隨著超濾膜截留的污染物在膜內表面和膜孔中的不斷積累，超濾膜的水通量和分離能力逐漸下降，通過反沖洗可以部分恢復膜的水通量，但反沖洗不能達到100%的恢復效果，因此當超濾膜的水通量下降超過30%時，進行清洗，及時清理附著在超濾膜壁和膜孔中的污染物，防止超濾膜形成不可恢復的堵塞。 清洗的方法主要有以下幾種：
1、用阻垢劑清洗劑將RO水或超濾水的pH值配制到2，經增壓泵從超濾膜的進水閥處打入，自排放閥處循環回來，調節排放閥將壓力穩定在0.25Mpa，循環清洗30分鐘后將進水閥、排放閥和調節閥全部關閉，對超濾膜密封浸泡2小時后再用超濾水沖洗干凈。
2、用阻垢劑清洗劑將RO水或超濾水的pH值配制到12，經增壓泵從超濾膜的進水閥處打入，自排放閥處循環回來，調節排放閥將壓力穩定在0.25Mpa，循環清洗30分鐘后將進水閥、排放閥和調節閥全部關閉，對超濾膜密封浸泡2小時后再用超濾水沖洗干凈。
3、加入0.5%的HY-240劑對超濾膜進行清洗，再進行循環藥洗或浸泡。
4、閥門操作見下圖所示
超濾膜的保存，超濾膜沒有使用時一般都是浸入保護液中進行密封保存以防止濕態膜脫水后產生收縮，膜孔變小，使膜結構破壞，水通量下降。
一、短期保存：超濾膜如暫停使用時（少于10天時間）應對超濾膜反沖洗一次，在反沖洗水中加入15ppm（ml/L）的HY-240劑后再將超濾膜的進水閥、排放閥和調節閥關閉，保持超濾膜的密封和作用。
二、長期保存：超濾膜如長期停止使用時（超過10天），先對超濾膜進行反沖洗一次，然后在超濾膜內注入HY-310保護液后密封保存（好是RO水）。
